슬롯 사이트 원주민 배경 변형 라이브러리의 일반 정보

DNA 변종 및 토착 배경 변종 라이브러리(IBVL) 구축

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DNA 변종이란 무엇입니까?

DNA(디옥시리보핵산)은 모든 세포에 들어 있는 유전 물질로, 부모로부터 물려받았습니다. DNA는 우리 몸이 어떻게 작동하는지에 대한 지침을 제공하며 우리 세포가 읽을 수 있는 4가지 유전적 '문자'(A, C, G, T)의 긴 문자열로 구성됩니다. 네 글자는 서로 다른 조합이나 순서로 계속해서 반복되며, 각 세포의 전체 DNA 길이에는 30억 개의 DNA 글자가 포함되어 있습니다.

DNA 서열 변형 — 그림 1: 두 개인의 DNA 서열. 대부분의 순서는 두 개인 모두 동일합니다. 그러나 차이점이 눈에 띕니다(한 위치에서 강조 표시됨). 이 차이를 변형이라고 합니다. 구체적으로 이 변형은 A에서 C로의 수정입니다.

모든 인류는 동일한 DNA 문자의 99.9%를 공유합니다. 우리가 대부분 동일한 DNA 서열을 공유하더라도 0.1%의 차이는 DNA에 사람마다 글자가 다른 부분이 여전히 많다는 것을 의미합니다. 이러한 글자 차이를 '변형'. 실제로 각 개인은 다음을 수행합니다.수백만변종이며 이것이 우리 각자를 독특하게 만드는 부분입니다. 이러한 변종의 대부분은 무해하지만(질병을 유발하지 않는 변종) 일부는 건강 문제를 일으킬 수 있습니다(질병을 유발하는 변종).

DNA 변종의 범위는 다음과 같습니다.자주에희귀모든 인구 내에서(예를 들어 그림 2에 표시된 것처럼 특정 DNA 위치에서 60%의 사람들이 A를 갖고 40%의 사람들이 C를 가질 수 있음).

인구 내 공통 변종 분포 — 그림 2: 5명의 개체군 내 공통 변이 분포를 나타냅니다. A 변종은 인구의 60%에 존재하고 C 변종은 40%에 존재합니다. 두 변종 모두 이 모집단에서 일반적인 것으로 간주됩니다.

백그라운드 변형 라이브러리(BVL)란 무엇입니까?

A백그라운드 변형 라이브러리(BVL)심각한 유전적 질환이 없는 사람들 그룹의 모든 DNA 변이 목록 또는 모음으로, 일반 인구에서 흔하거나 희귀한 변이를 결정하는 데 도움이 됩니다.변종이 심각한 유전적 질환이 없는 '건강한' 집단에서 흔하다면, 희귀 질병을 일으킬 가능성은 적습니다.

많은 BVL이 이미 존재합니다. 이 도서관은 책이나 목록을 물리적으로 모아 놓은 것이 아닙니다. 대신 DNA 변종 정보는 컴퓨터 데이터베이스에 저장됩니다. 공개적으로 사용 가능한 라이브러리의 한 예는 다음과 같습니다.gnomAD.

유전 전문가와 의사들은 이러한 BVL을 참조 자료로 사용하여 전 세계 다양한 집단의 사람들에게 어떤 DNA 변이가 흔한지 알아냅니다. 각 사람은 수백만 개의 DNA 변종을 가지고 있다는 것을 기억하십시오. 희귀 유전 질환이 의심되는 환자가 자신의 상태를 유발하는 DNA 변이를 찾기 위해 유전자 검사를 받는 경우, 질환을 유발하는 '의심되는' 질병 변이를 찾기 위해 유전자 검사에서 발견된 모든 DNA 변이를 분류하는 것은 큰 작업입니다.

탐정처럼 행동하는 의사는 환자의 변이 목록을 BVL에서 보이는 변이 목록과 비교하고 환자의 특정 인구 집단에서 희귀 질환이 없는 사람들에게서 발견되는 일반적인 DNA 변이를 신속하게 배제할 수 있습니다. 그러면 의사는 환자의 테스트 보고서에서 희귀한 변종에 집중할 수 있습니다.아님도서관에서 볼 수 있는(또는 아주 드물게 볼 수 있는) 질병을 일으킬 가능성이 더 높습니다.

요약하자면,BVL을 사용하면 일반 인구에서 볼 수 있는 일반적인 변이를 신속하게 제거하여 실제 '용의자'의 범위를 좁혀 유전 질환을 더 빠르게 진단할 수 있습니다.

이란 무엇입니까 원주민 백그라운드 변형 라이브러리(IBVL)?

IBVL(원주민 배경 변형 라이브러리)은 데이터베이스입니다.심각한 소아 유전 질환이 없는 원주민 집단에서 발견된 각 DNA 변이의 빈도를 보여줍니다.

전 세계 각 인구 집단에는 고유한 유전적 변이가 있으며 다른 인구 집단의 DNA에는 존재하지 않거나 다소 자주 발견됩니다.IBVL이 없다는 것은 유전 전문가와 의사가 어떤 DNA 변이가 흔한지 알지 못하므로 원주민에게 심각한 유전 질환을 일으킬 가능성이 적다는 것을 의미합니다. 이로 인해 원주민 환자의 유전적 질환을 진단하는 것이 다른 많은 환자보다 훨씬 더 어렵고 효율성이 떨어지게 됩니다. 의사가 환자의 희귀 질환을 일으키는 실제 '의심스러운' 변종을 찾으려고 노력할 때 일반 인구에서 볼 수 있는 일반적인 변종을 신속하게 배제할 수 없기 때문입니다. 안타깝게도 이로 인해 진단이 지연되고 잠재적으로 환자의 건강 관리 및 치료가 덜 효과적일 수 있으며 답변되지 않은 질문으로 인해 가족이 지속적인 스트레스를 받을 수 있습니다.

IBVL은 유전 질환 진단을 개선하기 위해 만들어진 임상 도구입니다.그것은 인간 샘플을 포함하는 바이오뱅크가 아닙니다. 또한 원주민 혈통의 수준이나 지리적 기원을 결정하거나 문화적 신념에 도전하는 데에도 사용되지 않습니다. 상업화, 특허권 취득 또는 SGP 참가자에게 '소비자에게 직접' 유전자 검사 결과를 제공하는 데 사용되지 않습니다.

목적은 원주민에게 게놈 의학의 이점에 대한 접근을 제공하는 것입니다.

희귀질환 변종 — 그림 3: 원주민 배경 변이 라이브러리를 사용하여 희귀 유전병을 진단하는 방법의 예. T 변종이 있는 아동이 원주민이고 IBVL이 없는 경우 의료 서비스 제공자는 T 변종이 원주민에게 흔한지 알 수 없으므로 질병을 유발할 가능성이 있는지 여부를 판단할 수 없습니다. 그러나 비교할 IBVL을 사용하면 의료 서비스 제공자는 T 변이가 IBVL에 없으며 따라서 희귀 질환의 잠재적 원인임을 알 수 있습니다.

IBVL 구축

사일런트 게놈 프로젝트 내의 IBVL 구축은 기술적인 노력을 훨씬 뛰어넘어 원주민 거버넌스의 발전이 보안 검토, 소프트웨어 개발 및 데이터 액세스 프로세스를 안내함에 따라 확장되었습니다. S-GIRDD 운영 위원회는 임상 진단의 의도된 목적에 대한 접근을 제한하고 원주민 환자가 적시에 IBVL의 혜택을 누릴 수 있도록 하는 사용자 접근 및 변종 출시를 위한 프레임워크를 구축하기 위해 집중적인 노력을 기울였습니다. 생물정보학자들은 인터페이스와 변종 호출 파이프라인(과학자들이 변종을 식별하기 위해 유전 정보를 필터링하는 데 도움이 되는 프로세스)이 포함된 소프트웨어를 개발했습니다. 그들은 S-GIRDD 운영 위원회에서 정의한 사양에 맞춰 프로세스를 조정하고 공개적으로 사용 가능한(비원주민) 데이터 세트에서 테스트했습니다. 프로젝트 팀은 인터페이스 테스트를 수행했습니다. 또한 IIGAC(Silent Genomes 국제 자문 기관)는 특정 상황에서 임상 진단 목적으로 원주민 변종의 안전한 공유를 촉진하기 위한 접근 방식에 대한 의견을 제공했습니다. 동시에, 커뮤니티 참여 코디네이터와 프로젝트 리더는 커뮤니티와 소통하여 샘플 전송에 대한 승인과 관련 프로세스의 완전한 투명성을 보장했습니다.

IBVL 정보는 어떻게 저장됩니까?

IBVL의 핵심 원칙은 개인 데이터(한 사람에게서 발견된 모든 DNA 변이 목록)를 사용할 수 없다는 것입니다. 변이의 모집단 빈도(각 변이가 전체 모집단에서 나타나는 빈도)만 포함됩니다.즉, 각 참가자의 변형 정보가 하나의 데이터 세트로 병합되어 어떤 사람의 데이터도 어떤 방식으로든 인식되거나 접근할 수 없습니다. 데이터에 대한 접근은 임상 진단 목적으로만 사용됩니다. IBVL 데이터베이스에서 전체 데이터 세트를 다운로드하는 것은 아님 허용됩니다.

개인 IBVL 데이터 안전 — *그림 4: 개별 데이터가 IBVL에 존재하지 않습니다. 인구 데이터만 존재합니다.*

IBVL 데이터베이스는 BC 주 밴쿠버에 있는 BC 어린이 병원 연구소(BCCHR)의 기관 서버에 보관되어 있으며 엄격한 보안 조치로 보호되고 정기적으로 감사되고 비밀번호로 보호되며 승인된 직원만 액세스할 수 있습니다.

SG-IBVL 거버넌스 위원회 및 원주민 데이터 거버넌스

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IBVL 거버넌스

Silent Genomes 프로젝트 내에서 생성된 데이터의 거버넌스는 다음에 의해 확립되었습니다.침묵 게놈 토착 희귀병 진단(S-GIRDD) 운영 위원회원주민 환자, 지역 사회 구성원, 원주민 조직(원주민 보건 당국, 메티스 국립 협의회) 대표로 구성됩니다. 위원회는 위임 조항을 개발하고, IBVL 사용자를 위한 변형 릴리스 프로세스를 확립했으며, IBVL 데이터 생성에서 출판물이 발생하는 경우 보고서 및 원고에 대한 검토 프로토콜을 개발했습니다.

IBVL이 승인된 의료 전문가에게 제공됨에 따라 S-GIRDD 운영 위원회는 다음으로 전환되었습니다.SG-IBVL 거버넌스 위원회, IBVL의 지속적인 거버넌스를 보장합니다. SG-IBVL 거버넌스 위원회는 임상 진단 및 관련 연구를 위한 데이터 액세스에 관한 정중하고 문화적으로 안전한 정책을 포함하여 IBVL의 공동 확장 및 활용을 지원하는 동시에 미래 세대의 원주민 학자 및 커뮤니티 구성원을 참여시키는 문화적 감독과 전략적 조언 및 결정을 제공합니다.

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위원회는 지식 전달자/장로, 원주민, 메티스 및 이누이트 공동체 구성원을 포함하여 원주민이 주도하고 운영하는 원주민입니다. 유전적 조건과 관련이 있거나 캐나다 건강한 마음과 정신 연합과 연결된 사람들, 원주민 학자, 청소년 및 신흥 지도자가 포함됩니다. SG-IBVL 거버넌스 위원회는 Silent Genomes 팀과 함께 IBVL이 확장됨에 따라 원주민 커뮤니티 및 지도자들과 협의 및 파트너십을 맺고 협력하여 참여하는 원주민 개인, 가족 및 커뮤니티가 자신의 게놈 데이터를 안전하게 보호하고, 동의 범위 내에서 윤리적으로 사용하며, 원주민 데이터 주권 원칙에 따라 관리되고, IBVL의 존재와 그 이상에 걸쳐 투명성, 책임 및 문화적으로 적절한 감독으로 보호되도록 보장합니다. 역할, 책임 및 기타 관련 정보는참조 약관.

I이게 게놈 데이터의 원주민 거버넌스를 위한 유일한 옵션인가요?

다른 프로젝트나 지역은 원하는 경우 자체 원주민 거버넌스 구조를 구축할 수 있습니다. Silent Genomes는 OCAP, UNDRIP 및 CARE 원칙에 맞춰 이미 운영되고 있는 하나의 옵션을 제공합니다.

범캐나다 게놈 라이브러리 및 게놈 연구

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범캐나다 게놈 라이브러리(PCGL)란 무엇입니까?

PCGL은 의사와 연구자가 캐나다 전역의 유전 데이터로부터 학습할 수 있도록 지원하는 국가 시스템으로 구상되어 모든 캐나다인에게 유전자 검사 및 치료가 더 효과적으로 이루어질 수 있도록 합니다. 비유럽 인구에 대한 공개 참조 게놈 데이터 및 관련 연구에는 많은 격차가 있으며, 캐나다의 약 절반은 자신의 조상이 비유럽인이라고 보고합니다.

중요하게는 원주민의 경우 대부분의 의학적 유전적 증거가 원주민을 포함하지 않은 인구 집단에서 나오는데, 이는 결과가 원주민 가족에게 완전히 적용되지 않는 경우가 많다는 것을 의미합니다. 관련 유전자 참조 데이터는 암 진단, 희귀한 아동기 질환 또는 갑작스러운 심각한 질병 중에 매우 중요할 수 있습니다. 원주민이 포함되지 않으면 의사는 적합하지 않은 증거에 의존할 수 있으며 정밀 의학은 실제로 건강 격차를 해소하는 대신 확대할 수 있습니다.

이 시스템에서 원주민 데이터는 어디에 있습니까?

게놈 연구에 참여하기로 선택한 원주민 참가자는 자신의 데이터를 IBVL에 배치하도록 선택할 수 있습니다. IBVL은 PCGL과 제휴하여 원주민들이 다른 캐나다인들과 동일한 연구 기회를 가지면서 그들의 데이터가 보호되도록 보장했습니다. Silent Genomes 프로젝트는 원주민의 게놈 연구 참여가 OCAP 및 UNDRIP에 따라 정중하고 안전하게 이루어질 수 있음을 이미 보여주었습니다. Silent Genomes의 IBVL은 원주민이 주도하는 거버넌스 위원회에 의해 관리됩니다. IBVL의 거버넌스는 PCGL과 별개입니다. 이 접근 방식을 연합 모델이라고 합니다. 이에 대해 생각하는 유용한 방법은 도서관입니다. 많은 책이 도서관에 있지만 각 책은 별도로 보관됩니다. 거버넌스를 요청한 원주민의 데이터는 고유한 상태로 유지되며 다른 데이터 세트와 혼합되지 않습니다.

원주민 데이터를 어떻게 사용할 수 있는지 누가 결정합니까?

IBVL 액세스에 대한 규칙과 조건이 이미 확립되어 있으며 이는 환자의 진단 확립 및 원주민과 관련된 건강 연구에 중점을 두고 있습니다. 연구자들이 IBVL을 사용할 수 있는 공개 접근 권한은 없습니다. 연구 프로젝트에 원주민 데이터가 필요한 모든 경우, SG-IBVL 거버넌스 위원회는 함께 모여 이 연구가 원주민에게 정확히 어떻게 도움이 될 수 있는지, 결과를 지역 사회와 공유하는 방법, 문화적 위험이나 기타 위험이 있는지, 이러한 문제를 해결할 방법을 결정합니다. SG-IBVL 거버넌스 위원회는 문화적 존중을 보장하기 위해 SG-IBVL 연구에서 나온 모든 출판물을 검토합니다. 이러한 규칙은 이미 시행 중이며 데이터가 국가 시스템과 관련된 경우 변경되지 않습니다.

누가 이 연구를 하고 있습니까?

IBVL 건설은 의학 분야의 컴퓨터 사용 전문가인 Dr. Wyeth W. Wasserman이 주도합니다. 박사님. Wyeth Wasserman, Laura Arbour 및 Nadine Caron이 전체 Silent Genomes 프로젝트를 이끌고 있습니다. 이 분야에는 다른 전문가(Ripan Mahli 박사, Simon Gravel 박사)와 다수의 연수생이 참여하고 있습니다.

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